Base de datos piloto iHEALTH es parte de Zenodo
Información ya está disponible online para que pueda ser utilizada por investigadores de todo el mundo.
Con el objetivo de contribuir a la disponibilidad de datos en el área de la imagenología médica, el Instituto Milenio iHEALTH ha puesto a disposición de la comunidad científica imágenes de rodilla tomadas en un equipo de resonancia magnética clínica de 0,55 T a través de la plataforma Zenodo, un repositorio de acceso abierto desarrollado bajo el programa europeo OpenAIRE y operado por la Organización Europea para la Investigación Nuclear (CERN), que permite a investigadores compartir datos para investigación.
Para Claudia Prieto, directora e investigadora principal de iHEALTH, la publicación de este tipo de información es un pilar para la colaboración científica global, “poner esta información a disposición de la comunidad científica es un paso relevante, ya que permite compartir datos anonimizados adquiridos en Chile en un equipo de resonancia magnética más accesible que los convencionales”.
Y agregó: “somos conscientes de que esta es una base de datos acotada, de 20 sujetos, por lo que debe entenderse como un punto de partida. Sin embargo, es un recurso valioso para desarrollar y validar nuevos métodos de imágenes médicas e IA. Actualmente, ya estamos trabajando en la adquisición de bases de datos de mayor escala, que serán fundamentales para profundizar en estos avances”.
El trabajo fue realizado en colaboración con el equipo del proyecto internacional A4IM (Imagen de resonancia magnética asequible, accesible, ajustable y precisa), liderado por Christoph Kolbitsch desde el instituto metrológico nacional de Alemania (PTB) y del cual nuestra directora forma parte.
Características de los datos
Ignacio Celis, tecnólogo médico de IHEALTH escaneó ambas rodillas de 20 sujetos reclutados mediante dos tipos de secuencias. En primer lugar, se aplicó un protocolo cualitativo consistente en ejecutar tres secuencias 2D consecutivas con trayectorias Cartesianas y parámetros optimizados para obtener imágenes ponderadas en Densidad de Protones (DP), T1 y T2, generando un total de 6 conjuntos de datos.
Por su parte, el protocolo cuantitativo se llevó a cabo con dos conjuntos de imágenes: una secuencia 2D de inversión Look-Locker Modificada (MOLLI) (3-3-5) para obtener un mapa de T1, y una secuencia de precesión libre de estado estacionario balanceado preparada en T2 (T2p-bSSFP) para obtener un mapa de T2.
Las imágenes fueron adquiridas en el plano sagital para una mejor visualización anatómica de la rodilla, con un tiempo total de poco más de 17 minutos por voluntario. Cabe destacar que se cuenta con el consentimiento informado de todos los voluntarios obtenido previo a la realización de las imágenes y con la aprobación ética para compartirlas de manera anonimizada con la comunidad científica.
